AlphaFold 3 把结构预测扩展到蛋白质、核酸与配体的全分子交互，但发布时的封闭访问引发争议。两年过去，DiffDock、Boltz、Protenix 等开源阵营追到了哪一步？AF3 又有哪些被实测证实的失败模式？本文梳理截至 2026 年 10 月的格局。

K-Dense 开源的科研智能体技能库：177 个覆盖基因组、药物发现、临床证据等领域的 SKILL.md，遵循 Agent Skills 开放标准，Claude Code、Cursor、Codex、Gemini CLI 都能直接安装。本文拆解它的渐进加载架构、上下文成本账本、分发与安全流水线，并给出五类落地场景与真实评测数字。